宏基因組測序(三代)
三代宏基因組測序
超長讀長,更真實(shí)地還原菌群及其功能組成
三代宏基因組測序擺脫了二代讀長短的限制,基于PacBio的超長讀長,能輕松覆蓋基因間區(qū)或基因特異性區(qū)域,更真實(shí)反饋菌群的復(fù)雜組成。除此之外,新三代測序技術(shù)-Nanopore 平臺, 除了具有超長的讀長之外,還以其更低的測序成本深受到研究者的關(guān)注,已成為宏基因組測序分析新的熱點(diǎn)。
應(yīng)用方向
新物種挖掘
功能基因挖掘
臨床快速診斷
諾禾優(yōu)勢
1.組裝更佳,注釋更精確
目前三代宏基因組研究配備先進(jìn)的PacBio、Nanopore測序平臺,結(jié)合樣品特點(diǎn)和數(shù)據(jù)的產(chǎn)出,選取最優(yōu)組裝效果,可以組裝出更多binning甚至可以達(dá)到單菌級別, 充分挖掘環(huán)境樣品中的微生物菌群和功能基因。已廣泛應(yīng)用于臨床、生態(tài)環(huán)境、農(nóng)業(yè)等研究中。
2.周期短,質(zhì)量好
高性能計(jì)算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展, 高性能計(jì)算平臺將會持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。